“Peykler Medresesi” ve “Saatli Medresesi”
Üç Şerefeli Cami’nin kuzeyinde ve bitişiğinde iki ünlü tarihî medrese bulunmaktadır. Bunlardan “Peykler Medresesi”ni Fatih Sultan Mehmet yaptırmıştır. Eski medrese binası onarılmış olup başka hizmetlerde kullanılmaktadır. Sultan II. Murat’ın yaptırdığı “Saatli Medrese” ise onarım sürecindedir ve Fatih Sultan Mehmet’in bu medresede öğrenim gördüğünü belirten kaynaklar bulunmaktadır. 16 Temmuz 2020 tarihinde Edirne Valiliği ve Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi arasında imzalanan protokol ile Saatli Medrese'nin Fatih Sultan Mehmet Müzesi olarak teşhir ve tanzimine karar verilmiştir. Bu kapsam da yapılan arama konferansı sonuç raporu doğrultusunda ve müze danışma kurulunun nezaretinde müze senaryosu yazılmış, sergi ve içerik tasarımı yapılmıştır. Fatih Sultan Mehmet Müzesi 25 Mayıs 2021’de resmen açılmıştır.